幾近完整的高質(zhì)量草莓參照基因組公布
2019-02-27 10:53:58
來源：人民網(wǎng)
據(jù)英國《自然·遺傳學(xué)》雜志25日在線發(fā)表的一項(xiàng)研究，美國科學(xué)家報(bào)告了一個(gè)幾近完整的草莓參照基因組。該高質(zhì)量基因組不但為了解草莓起源和演化歷史提供了新見解，還對未來改善其品種及提高抗病性大有助力。
八倍體栽培種草莓卡姆羅莎有8組染色體，也被稱為花園草莓，因其味美清香而深受喜愛。
此次，美國密歇根州立大學(xué)研究人員帕德里克·艾德格及其同事，對該八倍體草莓的基因組進(jìn)行了高質(zhì)量組裝和注釋，共鑒定出10萬多個(gè)草莓基因。研究團(tuán)隊(duì)對草莓屬二倍體種（擁有兩組染色體的草莓品種）的31組RNA分子進(jìn)行了測序，并將二倍體種的表達(dá)基因序列與八倍體栽培種草莓的表達(dá)基因序列進(jìn)行了對比。
研究團(tuán)隊(duì)隨后通過演化分析，鑒定出了森林草莓、飯沼草莓以及此前未知的綠色草莓和日本草莓，是八倍體栽培種草莓的4個(gè)二倍體祖先種。該分析結(jié)合現(xiàn)存種的地理分布還可以表明，八倍體草莓起源于北美。
除此之外，團(tuán)隊(duì)還對八倍體草莓的4個(gè)亞基因組開展了演化動力學(xué)分析，他們發(fā)現(xiàn)了一個(gè)占支配地位的亞基因組，能在很大程度上控制草莓的代謝和抗病性狀。
研究人員總結(jié)表示，草莓的演化和起源信息、占主導(dǎo)地位的亞基因組，以及首個(gè)八倍體草莓高質(zhì)量基因組，未來能作為研究人員和育種者改善栽培種花園草莓口味、香味和提高抗病性的有利資源。（張夢然）
(責(zé)編：劉婧婷、熊旭)
