北京時間2024年3月12日,Nature(《自然》)以加速預(yù)覽形式在線發(fā)表了武漢大學(xué)藥學(xué)院、泰康生命醫(yī)學(xué)中心、武漢大學(xué)中南醫(yī)院王隆飛教授團隊關(guān)于Gabija免疫系統(tǒng)防御機制的最新研究論文,題為Structures and activation mechanism of the Gabija anti-phage system。王隆飛教授和華中科技大學(xué)生命學(xué)院朱斌教授為該論文的共同通訊作者,武漢大學(xué)藥學(xué)院博士生李靜、華中科技大學(xué)生命學(xué)院博士后成銳、武漢大學(xué)藥學(xué)院副研究員王之明為共同第一作者。武漢大學(xué)為文章第一完成單位。
Gabija系統(tǒng)是自然界已知豐度第三,僅次于限制修飾系統(tǒng)和CRISPR系統(tǒng)的原核生物免疫系統(tǒng),僅由GajA和GajB兩個基因組成卻可以高效免疫各類烈性噬菌體的侵染,是自然界最廣譜高效且精簡的免疫系統(tǒng)之一。GajA蛋白是一種序列特異性的核酸內(nèi)切酶,且活性可以被ATP抑制,GajB蛋白是一種解旋酶類似物,可以水解ATP提供能量。近期已有兩篇Nature研究論文報道了噬菌體逃逸Gabija系統(tǒng)防御的結(jié)構(gòu)與機制,Gabija免疫機制受到高度關(guān)注,但其抵抗噬菌體侵染的分子機制尚未闡釋清楚。
該研究采用單顆粒冷凍電鏡和生物化學(xué)等技術(shù)手段,首次捕捉到了GajA核酸酶與DNA結(jié)合的激活狀態(tài)和與ATP結(jié)合的抑制狀態(tài),從分子層面完整的闡釋了Gabija系統(tǒng)的工作機制。Gabija系統(tǒng)在細胞正常生理狀態(tài)下被ATP抑制,在細菌受到噬菌體侵染后,由于噬菌體的快速復(fù)制消耗大量ATP,使得GajA不再受到ATP抑制。GajA四聚體兩端的Toprim結(jié)構(gòu)域向兩邊打開以方便DNA的結(jié)合,DNA在切割位點附近發(fā)生彎曲,以便于GajA的切割。帶切口的DNA又可以激活GajB的ATP水解活性,兩種酶活性巧妙配合最終導(dǎo)致細菌死亡和噬菌體感染的流產(chǎn)。因此,Gabija系統(tǒng)可能是以代謝物的耗竭作為危險信號,是一種獨特的原核生物免疫系統(tǒng)。該研究加深了人們對自然免疫系統(tǒng)的理解,為探索代謝物作為免疫防御的潛在危險信號提供了新的研究方向。